公司亏损和员工工资无关。公司亏损后拖欠员工工资的,员工可以及时向劳动行政部门举报,由劳动行政部门责令企业限期内支付,如果逾期不支付的,要向员工支付赔偿;员工也可以采用申请调解、仲裁、协商等方式来要回工资。
法律依据
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《劳动争议调解仲裁法》第四条发生劳动争议,劳动者可以与用人单位协商,也可以请工会或者第三方共同与用人单位协商,达成和解协议。第五条发生劳动争议,当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的,可以向调解组织申请调解;不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的,可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁;对仲裁裁决不服的,除本法另有规定的外,可以向人民法院提起诉讼。