应缴财政款是指单位取得或按照规定应当上缴财政的款项，包括应缴国库的款项或者应缴财政专户的款项。
为核算和监督应缴财政款，事业单位应当设置“应缴财政款”科目。该科目贷方登记应当上缴财政款项的增加，借方登记实际上缴财政款项的金额，期末贷方余额反映应当上缴财政但尚未交纳的款项。单位应当按照应缴财政款项的类別进行明细核算。
单位取得或应收按规定应缴纳财政的款项时，借记“银行存款” “应收账款”等科目，贷记“应缴财政款”科目。单位处置资产取得的应上缴财政的处置净收入时，借记 “待处理财产损溢”科目(处理净收入)，贷记“应缴财政款”科目。单位上缴应缴财政的款项时，按照实际上缴的金额，借记“应缴财政款”科目，贷记“银行存款”科目。