正反交是相对的 ，如果表现型为A的作父本 ，表现型为a的作母本为正交 那么a做父本A作母本时就叫反交。

细胞质遗传基因全部来自母本，正反交的基因型不一样，所以正反交的表现型不一样。所以正反交的表现型不一样的是细胞质遗传。细胞核遗传时来自父母的基因各一半， 对于纯合亲本而言，正反交的基因型相同 ，所以正反交的表现型相同。所以正反交的表现型相同的是细胞核遗传。