在印刷过程中，如果生物降解膜出现中间凸起，可以进行以下处理：

1. 调整印刷机械设备：检查印刷机的调整是否合适，包括压力、速度、温度等参数，确保其与生物降解膜的特性相匹配，以避免出现中间凸起。

2. 优化印刷工艺：考虑调整印刷阶段的工艺流程，包括涂布均匀性、曝光时间、印刷速度等，确保生物降解膜可以平坦地印刷。

3. 使用辅助工具：如果出现中间凸起问题，可以使用压辊或压瓶等辅助工具，对凸起部分进行压平处理，使其更加平整。总之，通过适当调整印刷设备、优化工艺流程以及使用辅助工具，可以解决生物降解膜在印刷过程中出现的中间凸起问题。