我没做过提取植物基因的实验，但是课上有做过提取人的DNA然后检测某一段基因的实验。

我想题主应该也是要检测某个基因吧，你用试剂盒提取出总DNA后然而根据你要的基因的片段设计引物用PCR扩增然后跑胶或测序鉴定皆可。不明白你要设置对照是什么目的。个人看法，以上。