蛋白质沉淀，外文名precipitation，破坏蛋白质分子的水化作用或者减弱分子间同性相斥作用的因子，使蛋白质在水中的溶解度降低而沉降下来转化为固体的分离方法。

用于蛋白质沉淀操作的方法很多，如等电点沉淀、盐析、有机溶剂沉淀、加入非离子型聚合物沉淀。加入聚电解质沉淀等。