芽孢又称内生孢子，是细菌休眠体。

常见的产芽孢细菌主要为芽孢杆菌属、 梭状芽抱杆菌属 、芽抱乳酸菌属等。产芽孢细菌在营养条件缺乏时，在细胞内形成圆形或椭圆形的芽孢休眠体。芽孢含水量极低，抗逆性强，能经受高温、紫外线，电离辐射以及多种化学物质灭杀等，在灭菌监测中，可利用芽孢的高抗逆性制备生物指示剂。之所以说芽孢是细菌的休眠体而不是繁殖体，是因为一个细菌只能形成一个芽孢，而且一个芽孢萌发也只能形成一个菌体。