基因文库的分类：基因文库可分为基因组文库和rDNA文库。

基因组文库就是把某生物的整个基因组DNA切成适当大小的片段（包括目的基因在内），分别与载体DNA组合，导入微生物细胞，进行克隆繁殖后收集在一起作为长期保存的遗传物质库。cDNA文库就是以生物细胞的mRNA为模板经反转录形成稳定的双螺旋DNA(即cDNA)，再将这些cDNA插入到载体DNA中，导入微生物细胞，所建立起来的克隆群。一个高质量的cDNA文库只代表了生物体某一器官或组织mRNA所含有的全部或绝大部分遗传信息。cDNA文库与基因组文库相比，其突出特点在于cDNA来自反转录的mRNA,不含冗余序列，通过特异性探针筛选cDNA文库，可以较快地分离到相关基因。而基因组文库特别是真核生物的基因组文库非常庞大，而且含有大量重复序列，无论采用何种分离方法都难以直接分离到靶基因片段。