核仁不是细胞器，核仁与核糖体的形成有关。

核仁的主要功能之一就是组装蛋白质合成的机器——核糖体。核糖体的生物发生包括rRNA的合成、加工和核糖体亚单位的装配等过程，是一个向量过程。从核仁纤维组分开始，再向颗粒组分延续。核糖体小亚单位成熟较早，大亚单位成熟较晚。¿核糖体的成熟作用仅发生在它们的亚单位被转移到细胞质以后，两个亚单位只有分别通过核孔进入细胞质中，才能形成功能单位。这可阻止有功能的核糖体与核内加工不完全的hnRNA分子接近。大亚单位中的5S rRNA基因并不定位于核仁上，不同物种其位置不同.