载体蛋白主要转运非脂溶性物质 或者亲水物质 如氨基酸、糖和金属离子；通道蛋白参与的只是被动运输；不与运输的分子结合。

比如水通道载体蛋白需要与被运输的分子进行结合 ，再比如葡萄糖的运输，两者都属于被动运输中的促进扩散。