生物体内组成核苷酸的生物碱主要是嘌呤和嘧啶二类杂环化合物，它呈现碱性，原因是由于它们的分子结构中都含有N原子，N原子上有一对未共用的电子对，能与H+（或质子）相结合，生物碱参与某种化合物的组成，则该生物碱就称为碱基，因为含有N，故叫含N的碱基。