在起诉离婚财产纠纷中,一般来说,不会直接冻结公司账户。

但如果一方为了防止另一方转移财产,向法院申请了财产保全,那么法院可能会对另一方的账户进行冻结。另外,如果公司账户内的资金属于夫妻共同财产,且法院判决将对该财产进行分割,那么在判决生效后,如果一方申请强制执行,法院可能会对公司账户采取相应的执行措施。
法律依据
《中华人民共和国民法典》 第一千零八十七条离婚时,夫妻的共同财产由双方协议处理;协议不成的,由人民法院根据财产的具体情况,按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等,应当依法予以保护。