南航原先有2个校区：即老校区和江宁区校区。

加上南航天目湖校区巳启用，加起来应是3个校区。此问题南航两个校区相距多远，可能指的是老校区和江宁校区。 1、南京航空航天大学明故宫校区：（老校区）在南京中山东路上（白下区御道街29号），位于明代故宫遗址，大多数研究生及博士生在那边。

2、南京航空航天大学将军路校区：在南京市江宁区将军大道29号，占地面积近1900亩，分东、西两区。 因此，两个校区相距约12.5公里。