核反应中质子、中子并没有消失，发生的只是原子核之间的转化，比如质子中子重组，或者质子中子相互转化。

质量数指质子中子个数之和，因此质量数守恒质子中子结合成原子核时要放出能量，而原子核分解为核子时要吸收能量。而根据E=mc^2，能量变化时质量要相应变化。因此表面上看核反应中质量是不守恒的。但根据相对论，反应后的粒子速度比较大，因此算上它们的动质量，质量仍然守恒。