主要区别是，性质不同、方式不同、原理不同，具体如下：一、性质不同1、呼吸作用呼吸作用一般指异化作用，是指机体将来自环境的或细胞自己储存的有机营养物的分子（如糖类、脂类、蛋白质等），通过一步步反应降解成较小的、简单的终产物（如二氧化碳、乳酸、乙醇等）的过程。

2、气体扩散气体扩散是指某种物质的分子通过不规则运动、扩散运动而进入到其他物质里的过程。

3、气体交换气体交换指肺泡和血液之间，以及血液和组织之间的气体交换。

二、方式不同1、呼吸作用是生物体将体内的大分子转化为小分子并释放出能量的过程。

2、气体扩散是某种气体分子通过扩散运动而进入到其它气体里。

3、气体交换是气体从分压高的一侧向低的一侧扩散。

三、原理不同1、呼吸作用是生物体内的大分子，包括蛋白质、脂类和糖类被氧化并在氧化过程中放出能量。

2、气体扩散气体分子在做无规则的热运动。

3、气体交换吸入的氧气和呼出的二氧化碳在体内进行交换。