南平的行政区划仅有州、县二级，由刺史(知州)与县令为其军政首长，这种形式与唐末五代藩镇并无二致。

不过，在南方九国中，州、县二级地方行政体制，只存在于南平，其间的根源即在于该政权惟有原唐代荆南镇一地。而且其原管诸州大多在唐末己被分割而出，在如此狭小的祖域内，显然已无法采用道、州、县的三级地方行政，其地方行政建制也只能因陌就简。