东南大学在校博士生原则上不可以申请其他专业，因为博士阶段的研究需要具备较深的专业背景和学术基础，转换专业需要重新从硕士阶段开始攻读，这需要花费更多的时间和精力。

然而，如果在校博士生有跨专业需求，可以考虑在博士阶段进行跨学科研究，与相关学科的教授进行合作，开展交叉学科的研究项目。这需要博士生具备较强的学术能力和实践能力，同时也需要得到导师和合作教授的支持和指导。此外，如果在校博士生想要转换专业，可以考虑放弃现在的博士学位，重新申请其他专业的硕士或者博士学位。这需要博士生仔细评估自己的学术兴趣和能力，以及未来的职业发展方向，做出明智的决策。综上所述，东南大学在校博士生原则上不能申请其他专业，但可以通过跨学科研究和合作、重新申请学位等方式实现跨专业发展。