澳门科技大学的学费因专业和学位不同而有所不同。

一般课程的硕士研究生学费为每年港币128,000~145,000元，内外全科医学学士为每年港币220,000元；本科生每年学费为港币110,000~125,000元，内外全科医学学士为每年港币210,000元；博士生一年的学费一般为12000元至15000元不等；艺术生的学费则更高，本科生每学年约澳门币9.9万元，研究生每学年约澳门币12.3万元，艺术生每学年约澳门币17.7万元1。总体而言，澳门科技大学两年全部学费在12W-16W之间，个别专业会稍微多一些，详情以当年实际设置为准