两所大学都是全球知名的高等学府，但从排名上看，东京大学23，复旦31，东京大学更好一点。

东大位列2022QS世界大学排名第23位，日本全国第1位；2020年软科世界大学学术排名第26位；2021泰晤士高等教育世界大学排名第36位；2021CWUR世界大学排名第14位；2020泰晤士高等教育世界大学声誉排名第10位。东京大学；2021年1月28日，泰晤士高等教育（简称THE）发布2021年全球国际化大学排名，东京大学排名第132位。

2021年6月9日，世界高等教育研究机构QS Quacquarelli Symonds发布了最新2022QS世界大学排名，今年的排名共有1300所院校上榜。其中复旦大学排名31位。