应该算是一本。

南京财经大学是一所以经济管理类学科为主，经济学、管理学、法学、工学、文学、理学等多学科支撑配套、协调发展的江苏省属重点建设大学。按照通俗说法，凡是属于本科第一批次招生的话，就算是一本大学。南京财经大学在江苏省本科是第一批次录取，所以可以说南京财经大学是一本大学，会计学院自然也是属于一本。