南邮有三个校区，仙林校区、三牌楼校区、锁金村校区。

仙林校区是南邮主校区，在栖霞区文苑路9号，本科生和研究生都在该校区学习。校园环境优美，教学设施和师资一流，是三个校区中最好的。三牌楼校区是南邮老校区，位于鼓楼区新模范马路66号，位于市区，交通便利，生活气息浓厚，目前主要是继续教育学生和部分研究生在该校区。锁金村校区是原来南京人口管理干部学院的校区。

2013年7月23日，南京人口学院并入南京邮电大学。该校区有人口学院相关专业在该校区学习。该校区在玄武区龙蟠路，位于玄武湖畔，风景优美，交通便利。