在办理个体户营业执照时，房屋用途应按照实际情况填写。

如果房屋是用于居住的，可以填写“住宅”。如果房屋是用于商业经营的，可以填写“商业”或“商用”。如果房屋是用于工业生产的，可以填写“工业”。如果房屋是用于农业生产的，可以填写“农业”。如果房屋是用于其他用途的，可以根据具体情况选择相应的选项。