申请部门的理由通常应该包括以下内容：

1. 需求解释：解释为什么需要该部门，包括目前存在的问题和该部门能够解决的问题。

2. 目标明确：说明该部门的目标和职责，并说明如何帮助实现公司的战略目标。

3. 市场调研：通过市场调研和竞争分析，说明该部门的必要性和竞争优势。

4. 成本效益：说明该部门的成本和预期效益，以证明该部门是值得投资的。

5. 人员需求：说明该部门需要的人力资源，包括专业技能和经验要求。

6. 未来发展：说明该部门的未来发展前景和潜力，以证明该部门是公司未来发展的重要组成部分。以上是申请部门的理由应该包括的内容，具体内容可以根据实际情况进行调整和补充。