院系公章跟学校公章的区别为：归属不同、数量不同、代表不同。

一、归属不同1、院系公章：院系公章洞者属于院系所有。

2、学校公章：学校公章属于弯闭学校所有。

二、数量不同1、院系公章：一个学校可以有多个院系公章。

2、学校公章：一个学校只能有一个学校公章。纳闹薯三、代表不同1、院系公章：院系公章代表院系的行为，具有法律效力。

2、学校公章：学校公章代表学校的行为，具有法律效力。