他曾经表示：“因为我知道自己的极限，我再也没有新的战术创意了。这就是我离队原因，没有其他原因。”

2006年11月4日，瓜迪奥拉宣布退役。

瓜迪奥拉自己的解释：“在巴萨执教四年是非常漫长的，去年12月初我就对俱乐部主席和苏比萨雷塔表示，我在巴萨的周期接近结束了。但我不能告诉球员，因为主帅是更衣室的一大支柱。时光耗尽一切，我已经筋疲力尽了，这是我要离开的主要原因。”

主要两方面的原因，第一他和巴萨的几个主力球员关系出了问题，梅西等主力和他关系越来差。

第二，他和巴萨管理层，特别是时任巴萨主席相处的很不好，经常因为各种事闹矛盾，在加上当时巴萨成绩也不好，所以彻底引爆了矛盾。

瓜迪奥拉离开巴萨，那是因为拉波尔塔离任。

巴萨新东家上任，瓜迪奥拉的处境非常尴尬。毕竟瓜迪奥拉是拉波尔塔钦点的。当初为了让瓜迪奥拉成为一线队主帅，他甚至放弃了穆里尼奥的执教，但当新东家上任后，瓜迪奥拉只能选择离开。