1、南京大学的王牌专业包括天文学、地质学、图书情报与档案管理（A+类学科），以及哲学、社会学、中国语言文学、外国语言文学、中国史、物理学、生物学、计算机科学与技术、环境科学与工程、软件工程、工商管理（A类学科）。

此外，还有理论经济学、法学、数学、化学、地理学、生态学、电子科学与技术（A-类学科）。

2、南京师范大学的王牌专业包括小学教育、体育教育、新闻学、美术学、音乐学、哲学、思想政治教育、数学与应用数学、电气工程及其自动化、法学、学前教育、英语、汉语言文学、地理信息科学、生物科学、应用心理学、工商管理、化学、教育技术学、社会体育指导与管理、俄语（国家级专业）。

3、南京信息工程大学的大气科学和应用气象学专业被评为A++和A级，分别位于全国第三和榜首的位置，同时，数字媒体艺术与动画专业也表现出色，被评为A级。