主要区别在于地理位置、专业设置、发展定位等方面。

地理位置：漳州校区位于福建省漳州市，而翔安校区则位于厦门市翔安区。这两个校区分别位于厦门大学的主校区（思明校区）的不同方向，漳州校区位于厦门大学的西南方向，而翔安校区则位于东北方向。专业设置：漳州校区主要承担一些理工科专业的教学和研究，如海洋科学、环境科学等。而翔安校区则更多地承担人文社科、经济管理等专业的教学和研究。

3 校园环境：两个校区的校园环境各有特色。漳州校区以其优美的自然环境和宁静的学习氛围著称，而翔安校区则以其现代化的建筑风格和丰富的文化活动吸引着学生。发展定位：漳州校区作为厦门大学的分校，主要服务于海洋科学、环境科学等领域的科研和教学，同时也承担着培养相关领域人才的任务。翔安校区则更多地承担着推动人文社科、经济管理等领域的发展，以及提升厦门大学整体学术水平和国际影响力的任务。总的来说，虽然厦门大学漳州校区和翔安校区在地理位置、专业设置、校园环境和发展定位上有所区别，但它们都是厦门大学的重要组成部分，共同服务于厦门大学的教育和研究使命。