吉首大学的命名并没有特别的故事或背景。

吉首大学位于湖南省吉首市，是一所综合性大学，具有本硕博学位的授予权。学校地跨湘西州吉首市和张家界市永定区，是目前湖南省唯一一所校区地跨两个州市的综合类大学，也是湘鄂渝黔边区唯一一所拥有本—硕—博三级学位授予权和博士后科研流动站的高校。至于为什么选择“吉首”作为校名，可能主要是因为吉首市是学校的所在地，同时也是为了突出学校的地域特色。同样的命名方式也体现在其他一些高校，如吉首大学的“吉大”简称也是由“吉首”二字直接得来。