北京交通大学王牌专业有通信工程、轨道交通信号与控制、电子科学与技术、自动化、信息工程、计算机科学与技术、物联网工程、信息安全、经济学、信息管理与信息系统等，可以算得上是最好的一些专业了。

在教育部全国第四轮学科评估中，北京交通大学A类学科名单如下（5个学科）

A-：信息与通信工程、计算机科学与技术、交通运输工程、工商管理