复旦大学历史地理研究中心（不是历史系）的最好，国家重点学科，按历史学招生。

北京大学城市与环境学院也有历史地理按理学招生，北京大学历史系的历史地理按历史学招生。北京大学地理学是国家重点学科所以城环的历史地理也是国家重点学科，北大历史学一级学科是国家重点学科，所以理论上其历史地理也是国家重点学科。陕西师范大学西北环发中心（也不是历史系）的历史地理也是国家重点学科，按历史学招生。其他大学武汉大学、暨南大学、西南大学、华中师范大学、东北师范大学、甚至中国海洋大学也有历史地理学。华中师范大学历史文化学院和城市与环境学院都有历史地理，分别按历史学和理学招生。