两所学校都是属于本科二批，也就是本质是一样的，不过你也可以看看两所的学校的录取分数线，不过长沙的牌子比吉首的要大，自己考虑吧。

1.都比较好。

2.长沙学院，源于1979年开办的长沙基础大学，现在属于湖南省“双一流”高水平应用特色学院。吉首大学，成立于1958年，是湖南省高水平建设大学、湖南省国内一流学科建设高校。

3.长沙学院和吉首大学，都是公办本科大学，各有特色、各有所长，都是比较好的大学。