澳门科技大学在国际排名和影响力方面优于上海海洋大学，尤其在药理/毒理领域有较强的研究实力。

上海海洋大学在农业科学领域有较强的研究实力，也有一定的工程和环境/生态方面的优势。两所大学都有各自的特色和优势，具体选择哪所还要看你的个人兴趣、专业方向、就业目标等因素。