经济学院成立于1989年，是云南大学第一所实行校、院、系三级管理的学院。

经济学院的前身——云南大学经济系，在云南大学成立时（1923年）即同时建系，是中国大学中最早成立的经济系之一。截至2012年，经济学院（会计学院）设有经济系、对外经济贸易系、会计系、金融系、财政税收系、风险管理与保险学系六个系，有农村发展研究中心等11个科研机构，有经济学、国际经济与贸易、会计学、注册会计师、金融学、保险、国际商务、财政学等八个本科专业和专业方向；有理论经济学和应用经济学一级学科硕士点，有会计、审计、资产评估和国际商务四个专业硕士学位授权点；有理论经济学一级学科博士点和理论经济学博士后流动站。