国家级特色专业：经济学、会计学、化学

浙江省重点（建设）专业：人力资源管理、国际经济与贸易、计算机科学与技术、数学与应用数学、机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、化学工程与工艺、土木工程等

浙江省“十二五”优势专业建设项目：经济学、会计学

嘉兴学院王牌专业有临床医学、会计学、工程管理、护理学、电子信息工程、经济学、人力资源管理、学前教育、纺织工程、机械设计制造及其自动化等，可以算得上是最好的一些专业了。