清华大学在工程领域、计算机科学、电子信息、物理学等理工科方面有着很高的学术声誉，并在全球范围内都具备很高的排名。

南开大学则在经济学、管理学、人文社科、教育学等领域也有着很强的实力和影响力。南开大学的经济学专业在中国享有很高的声誉，经济学院也经常参与到国内外重要的经济研究中。综上所述，在特定的学科领域，南开大学可能会有自身的优势和特色，而清华大学在其他学科领域则可能有更强的实力。但无论在哪个学校，不同专业的强弱也可能会随时间和发展变化，因此选择适合自己的专业和学校更重要的是考虑到自己的兴趣、目标和求职需求。