西安交通大学的前身是1896年创建于上海的南洋公学;1905年划归商部，改名为高等实业学堂;1906年改隶邮传部，更名为邮传部上海高等实业学堂， 1911年，辛亥革命爆发，学校改名为南洋大学堂;1912年民国成立后，划归交通部管理，遂更名为交通部上海工业专门学校;1921年上海工业专门学校、唐山工业专门学校、北平铁道管理学校、北平邮电学校合并成立交通大学。

新中国成立后，根据国家经济建设发展战略的需要，国务院决定1956年交通大学的主体内迁西安。1959年定名为西安交通大学，并被列为全国重点大学。

2000年4月经国务院批准，西安医科大学、陕西财经学院与西安交通大学实现合并。