云南工程职业学院并没有出现在教育部陆续推出了高职双高计划、优质专科高职、国家示范高职、国家骨干高职名单中，所以从这个角度来看，云南工程职业学院是一所在专科中综合实力较为一般的学校。

值得一提的是虽然办学时间不长，但学校办学成果丰硕。学校先后被评为“云南省文明学校”、“云南省民办教育优秀高等院校”；2015年，经云南省教育厅审定，学校顺利通过“内涵与特色”评估。

2016年，成为云南省特色骨干民办高职院校建设单位，被国家教育部评为“国防教育特色学校”，获批云南省普通高校“专升本”考试考点资格。