南充市国家一类保护植物仅有引进栽培的水杉一种；二类保护植物中野生的有香果树和狭叶瓶尔小草两种，栽培的有银杏和杜仲两种；三类保护植物中野生的有红豆树、八角莲、天麻三种。

农作物以水稻、小麦、玉米和红薯为重要的粮食作物。大豆、豌豆、绿豆、扁豆等种植较普遍。花生、油菜、棉花、黄麻、红麻是重要的经济作物。川芎、天麻、麦冬、半夏是南充的主要野生药用植物。