1971年，昆明农林学院在寻甸与云南农业劳动大学合并成立云南农业大学。

1980年，云南农业大学由寻甸搬回昆明北郊黑龙潭原址办学。1983年，云南农业大学完成迁校工作，经国务院学位委员会批准，云南农业大学增列为硕士学位授予单位。1993年，云南农业大学列为云南省属重点大学。

2003年，云南农业大学成为博士学位授予单位。