新疆地区种植的棉花种子主要有中棉所系列、岱字棉系列、豫杂棉系列等。

其中，中棉所系列包括中棉所49、中棉所70等品种，这些品种具有较好的抗病性和适应性；岱字棉系列如岱字15、岱字14等，这些品种产量高、纤维品质好；豫杂棉系列如豫杂35、豫杂57等，这些品种生长势强、结铃性好。此外，还有诸如新陆中系列、新研系列等其他品种，它们各具特点，适应不同的种植环境和需求。