小肠粘膜主要分泌消化酶和黏液。

消化酶包括胰脂肪酶、胰蛋白酶、胰淀粉酶等，这些酶在小肠内将食物中的蛋白质、脂肪和碳水化合物分解成小分子物质，以便于人体吸收。黏液则起到保护小肠粘膜的作用，防止食物颗粒直接摩擦损伤粘膜。同时，黏液还有助于形成食糜，使食物在小肠内缓慢移动，延长消化时间。