真核生物的基因结构包括编码区上游，那里有启动子（RNA聚合酶结合位点在启动子），编码区，和编码区下游（此处有终止子）。

编码区内包含交替排列的内含子和处显子（都是特殊的脱氧核苷酸序列）内含子转录的部分不决定氨基酸。只有外显子转录的部分决定氨基酸。所以真核细胞的基因转录的mRNA在细胞核内必须把内含子转录的部分切去，把各个外显子转录的部分重新接起来，才能成为一个成熟的mRNA，从核孔中出来进入细胞质。