申办《动物防疫合格证》流程如下：一、办事应当具备的条件（申办资格）：1、凡从事饲养畜禽的饲养场。

2、凡从事动物饲养、屠宰、诊疗、动物及动物产品经营、加工、储藏的场所。

3、凡从事其他与动物及动物产品有关的场所。

二、审批依据：《中华人民共和国动物防疫法》第五章第四十四条规定动物饲养场所、储存场所、屠宰厂、肉类联合加工厂、其他定点屠宰场（点）和动物产品冷藏场所的工程的选址和设计，应当符合国务院畜牧兽医行政管理部门规定的动物防疫条件。

三、办事所需要的手续、材料、相关文件：1、申请人填写的《动物防疫合格证》申请表。

2、法人代表证明或业主身份证复印件。

3、饲养场所在地用地证明复印件。

4、经营加工场所的房产证明或承租协议复印件。

5、从业人员的资格证书复印件。防治人员畜牧兽医专业毕业证或结业证原件和复印件每人1份；身份证原件及复印每人1份。

6、有关动物防疫制度书面材料。

7、国家和省规定的其它证明材料。

四、办证地点：农业局