如果注册营业执照时填写的房屋编码无效，可以尝试以下几种方法解决：

1. 确认填写的房屋编码是否正确，如果不确定，可以咨询当地房产管理部门或者房屋所在的物业公司，获取正确的房屋编码。

2. 如果填写的房屋编码属于异地编码，可以联系当地工商行政管理部门，了解是否需要填写本地编码或者办理异地营业执照的手续。

3. 如果填写的房屋编码已经过期或者被废弃，可以联系当地房产管理部门或者物业公司，申请更新或者重新分配房屋编码。

4. 如果以上方法都无法解决问题，可以联系当地工商行政管理部门，了解具体的解决方法，并按照要求提供相关证明材料，重新填写或者更改营业执照上的房屋编码。需要注意的是，营业执照上的房屋编码是一个重要的标识，如果填写错误或者无效，可能会影响企业的经营和发展。因此，在填写营业执照时，一定要仔细核对房屋编码的准确性。