第一，使封建官僚机构形成完整严密的体系，提高了行政效率，加强了中央的统治力量。

第二，使宰相的权力一分为三，三省长官的品级又较低，这就削弱了相权，加强了皇权。在秦汉，丞相协助皇帝处理全国政事，处于“一人之下，万人之上”的地位。每当皇帝无能，丞相就可能专权。三省六部制的设立，三分相权，有利解决皇权与相权的矛盾，加强了皇权；同时扩大了议政人员的名额，收到了集思广益的效果；第三，各部职责有明确的分工，有利于皇帝的集权与政令的贯彻执行，提高了行政效率，充分发挥了国家机构的效能。三省六部制是中国官制史的重大变革，它标志着封建政治制度的成熟。此后，历朝基本上沿用这种制度