南京市的高中生物课程主要使用人教版（人民教育出版社）的教材。

这套教材内容全面，结构清晰，注重理论与实践相结合，适合高中生学习生物学知识。教材中包含了细胞学、遗传学、生态学等多个领域的知识点，旨在培养学生对生物科学的兴趣和认识，为未来的学习和研究打下坚实的基础。