我国大学的行政主管部门最主要的是教育部，多数高层次大学是 教育部直接管辖，而绝大多数院校归地方管辖。再就是一些特色院校归各个部位，单位管辖。具体 给大家整理了一下

一，教育部直属75所，清华，北大等。

二，军队院校26所，

三，其他部委中，工业和信息化部6所，层次比较高，民航，公安，民族事务，体育，司法，应急等等都有。

四，新疆建设兵团9所

五，其他为各省教育厅管辖

大学的主管部门与大学的级别有关。国家级别的大学有教育部管理，省级的大学有省教育厅主管，市级的大学有市教育局管理。凡公立大学都有各级政府部门管理，私立学校有相应政府部门管理，具体工作则有相应的教育管理部门管理，所以不同性质的大学有不同的政府和教育主管部门管理。