截至2018年，有53所。

南京大学，东南大学，南京航空航天大学，南京理工大学，南京工业大学，南京邮电大学，南京林业大学，南京信息工程大学，南京农业大学，南京医科大学等南京大学：南京大学简称南大，是我国的重点双一流大学，其办学历史非常悠久，据了解该校的前身是建于1902年的三江师范学堂，此后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学、国立第四中山大学、国立中央大学、国立南京大学等。