南京市拥有两所著名的985工程大学，分别是南京大学和东南大学。

南京大学，简称“南大”，是中国最早的国立大学之一，以其深厚的历史底蕴和卓越的学术成就享誉国内外。东南大学，简称“东大”，以工程学科见长，其工科实力在国内名列前茅。这两所大学均为中国顶尖的高等学府，为国家的科技进步和社会发展做出了重要贡献。