要防止大棚两侧下雨进水，可以采取以下措施：首先，安装防水膜或防水涂料在大棚两侧墙壁上，确保墙壁具有良好的防水性能。

其次，加装挡雨板或挡雨帘在大棚两侧，以阻挡雨水的进入。此外，定期检查和修复大棚墙壁的漏洞和裂缝，确保墙壁的完整性。最后，合理设计大棚排水系统，确保雨水能够顺利排出，避免积水导致进水问题。综上所述，通过防水处理、挡雨措施和排水系统设计，可以有效防止大棚两侧下雨进水。